Magic Lantern yazılımcısı a1ex'den alıntı yapıp konuyu kapatayım:
If you don't like those ISO's, set ISO from Canon menu. Problem solved.

Görüntüye bakarsın beğenirsin kullanılrsın. Ben 550D ile kendim denedim ve 160 ve katları olan değerlerde gerçekten daha az gürültülü sonuçlar aldım. Zaten kimse bu değerlerin "Native ISO" oldugunu söylemiyor. Bildiğim kadarıyla canon un halt yemesinden oluyor.

Ayrıca verdiğin 3 linkte de aynı şeyi söylemişler. Native ISO değil, fakat daha net ve gürültüsüz.

"....... so I will prefer to use the 160-multiple ISOs (320, 640, or 1250) so I can get more exposure with less noise."

"I’ve always used these settings. I start at 160 ISO, then 320, 640, 1250, 1600…"

Yani denersin low light da kendin de bariz farkı görebilirsin, tek diyeceğim o. Araştırmak güzeldir tabi.